Bei mir sammelt sich auch immer ein wenig Schmutz in der Pumpenkammer - ist aber doch auch nicht schlimm. Ich spüle jede Woche die Bodenabläufe 1 bis 2 mal, dann ist der Schmutz weg. Dauert max. 5 Minuten.
Wenn Dich der Schmutz stört, leg doch einfach eine kleine Strömungspumpe in die Pumpenkammer.