Unterhalb des Wasserspiegels in den Teich zurück ist kein Problem, dass funktioniert auf jeden Fall. Je nachdem wieviel Wasser du durch dein System pumpst würde ich überlegen eventuell einen zweiten Rücklauf als Reserve zu installieren. Kannst du ja erstmal Blind machen, aber gerade beim Teichbau würde ich immer etwas Reserve einplanen. Deine Koi werden wachsen, deine Besatzdichte wird wachsen und eventuell wird auch dein Filter in ein paar Jahren nochmal ausgetauscht.
1 Bodenablauf und 1 Skimmer sollte meiner Meinung nach langen, wenn die Teichform gut gewählt ist. Bei einem Rechteckbecken würde ich vll einen zweiten BA einbauen.